故事紧接着第一集，青马大桥一战后，贺英（甄子丹饰）坠海下落不明，目睹了事发过程的小美（黄圣依饰）则饱受八卦周刊的困扰，只得躲在闺蜜家中，一边逃避采访，一边寻找贺英。另一方面，元龙（任达华饰）动用了大批警力找到贺英，并借助四百年前桃园村民含冤被诛的事情，迫使贺英开启时空金球，回到明朝、拯救村民。贺英在出发前与小美相遇，并向她表白，无奈两人还是暂时分开。贺英与元龙一起前往北京寻找时空金球的下落，距离目标越近，离危险也就越近。